战斗中被烧毁了十多艘漕船，它们的残骸沉入了河底，夜袭时刘良佐派出船只堵塞了南北的航道，也必须把沉船打捞出来，船队才能继续前行。

河面上浮尸数千，河底里到处都是掉落的刀枪武器以及各种物质。浮尸需要打捞上来掩埋，刀枪物质捞起还能使用。

整个战斗中，受伤的士兵一千多，轻伤的需要包扎救治，重伤不能继续行军作战的则派人送回淮安养伤。

最麻烦的是俘虏的处理，一万五千余的俘虏，这个人数太过庞大。

第一步要做的就是淘汰老弱病残，这些不能打仗的一律发放二两银子放其还乡，无家可归者可到淮安，有官府负责安置。

高杰军中士兵都是从陕北一路逃亡过来，老弱病残大都死在行军途中，活下来的都是强壮年。不过刘良佐军中就有些良莠不齐，为了扩充军队，携裹了很多百姓从军。最后，刷下去的老弱约有一千多，这些人都发放了一笔安家银子让其还乡。

然后，陈越再次下令，所有不愿继续从军的降军也可以领取二两银子还乡，当下里又走了一批，剩下的却依然有一万二千多。

因为对于大多数士兵来说，他们已经习惯了当兵吃饷从军打仗，让他们放下武器反倒不知道干什么。而且对于很多人来说，他们之所以当兵基本上是活不下去，即使回到家乡也无法谋生。特别是高杰的属下，他们的家乡远在数千里外，根本是无家可归。

当然，也有愿意领银子回乡者，比如李本深和高进库。

路振飞答应高杰不会株连，所以李本深和高进库并没有因为是高杰的亲信而受到牵连。不过这两人自知无法在平南军混下去，便带着高杰的妻子刑氏和幼子离开了。陈越也没有为难他们，给了一笔银子放行，当然只是他们本人离开，不允许他们带走武器和军队。

对这些降军的使用，陈越很是为难，最省事的办法当然是还让原来的军官领兵，一切都如以前，这些降军不需要怎么训练就可以拉上战场。可那样自己也就丧失了对军队的控制力，而这些军队说不定什么时候还会再次背叛自己。就像投降李自成的明朝军队，当李自成败了之后，又纷纷投降了满清，就是因为李自成根本没有对这些军队进行改编。

所以，必须对这些降军进行整编，然后才能使用，当然这很麻烦，也需要时间。

明末的军队，从来都是兵为将有，士兵几乎是将领的私产。为了打破这种模式，为了割裂降军中军官和以前的家丁亲卫的联系，陈越下令，所有总旗以上的军官都跟从大军攻打南京，当然，这些军官不许带任何亲卫。

这批军官人数有四百余人，陈越把他们和六百平南军步兵编制成一个营，号称教导营，由陈越自己亲自担任统领，调陈平为副将。

不管是降军中的副将还是参将游击，入了教导营都从小兵做起，学习平南军的军制以及军规戒律。