最后，由禁卫军第一师、第二师进行了一番对抗演习，让这些武将观摩了一下禁卫军整齐的行军队伍、快速推进的行军速度、攻坚克难的能力等内容。除了震慑某些心怀鬼胎的武将外，也是将改革后的禁卫军的战斗力展示给其他的武将，让他们接受军事改革的提议。

经过了对禁卫军战斗力和武器的实际观摩后，杨毅在第二天军事会议上提出的军衔、军制改革，获得了大多数将领的支持。高杰、刘泽清等少数人也默不出声，不敢跳出来进行反对。

在这次历时四天的大明中央军事会议上，除了将禁卫军的军衔、军制向江南各省所有大明军队推广外，杨毅还根据各省防区、驻地划分了五个军区。

南京军区，总司令为徐孚远中将，兼任禁卫军军长，节制直隶省所有军务，包括江北四镇。

武昌军区，总司令为武昌侯左良玉中将，节制湖广省、江西省。

西南军区，总司令为解学龙，由原兵部右侍郎调任，授予少将军衔，节制四川省、云南省、贵州省。当然，四川省大部分地区已经被张献忠占领，但还是有少部分地区仍然在南京朝廷的控制之下，西南军区仍然要将这些地区的防务负责起来。

福州军区，总司令为郑成功少将，节制浙江省、福建省以及所有中国海域，部队以海军为主。

广州军区，总司令为原来的两广总督张同敞，节制广东省、广西省。

除了这些军区的划分、总司令的任命外，杨毅还对几个在历史上就有劣迹的武将进行了调任，其中以淮安总兵刘泽清和徐州总兵高杰为主。

因为兵部右侍郎解学龙出任西南军区总司令，杨毅就将刘泽清调入南京朝廷，出任兵部右侍郎了。

在职务上，南京兵部右侍郎比淮安总兵要高，加上刘泽清性格懦弱，又被禁卫军表现出来的强势所震慑，最后无奈接受了这个调任。刘泽清空缺的职务，由史可法原来的副将、义子史德威出任。

而徐州总兵高杰，则被杨毅调到广州军区去任副总司令，看起来也是升职了。实际上，由徐州总兵调到人生地不熟的广州军区去，还是副职，要受总司令张同敞的直接管辖，实际权力是被大幅度缩小了。

而高杰空缺的职务，就由历史上的民族英雄、抗清义士、现任的兵部主事夏允彝出任。

还有一些其他在历史上留下叛国降清、苟且偷生等劣迹的武将，纷纷被杨毅以各种理由调到了其他职位上去，充分发扬了“明升暗降”的精神，为他掌握江南所有军权扫除了障碍。

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